86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3684 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 1400 aa  2897    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 1067 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  27 
 
 		 1444 aa  88.2  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  25.61 
 
 		 442 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  22.18 
 
 		 333 aa  83.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  29.82 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  22.82 
 
 		 331 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  22.82 
 
 		 331 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 1303 aa  80.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  22.41 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  22.87 
 
 		 331 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 		 746 aa  76.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  21.99 
 
 		 331 aa  76.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 1312 aa  75.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  22.72 
 
 		 1256 aa  70.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 987 aa  69.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  22.78 
 
 		 325 aa  67.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2171  hypothetical protein  25.42 
 
 		 711 aa  66.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.201556  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 		 1059 aa  66.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 		 1035 aa  66.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  22.18 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  29.59 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 924 aa  65.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0237  hypothetical protein  28.25 
 
 		 331 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 1314 aa  64.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 1301 aa  63.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  24.79 
 
 		 424 aa  62  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  26.46 
 
 		 447 aa  60.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  24.38 
 
 		 352 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 		 814 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 		 995 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  21.65 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  20.44 
 
 		 778 aa  57.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  19.73 
 
 		 425 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  20.45 
 
 		 325 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  34.96 
 
 		 591 aa  57.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  21.21 
 
 		 1147 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 		 384 aa  56.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  20.06 
 
 		 425 aa  55.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  22.11 
 
 		 1008 aa  55.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  23.89 
 
 		 638 aa  54.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 419 aa  54.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  22.47 
 
 		 1287 aa  54.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 1220 aa  53.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 379 aa  52.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.21 
 
 		 1867 aa  52  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  21.03 
 
 		 442 aa  51.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  20.85 
 
 		 436 aa  50.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 413 aa  49.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 441 aa  49.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  46.15 
 
 		 537 aa  49.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 404 aa  49.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 404 aa  49.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  22.38 
 
 		 445 aa  48.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  26.47 
 
 		 322 aa  48.5  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1049 aa  48.5  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 1313 aa  48.5  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 		 440 aa  48.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  35.06 
 
 		 569 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 414 aa  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  23.89 
 
 		 413 aa  47.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  21.89 
 
 		 403 aa  47.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 		 539 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  21.89 
 
 		 403 aa  47.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.05 
 
 		 388 aa  47  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 		 379 aa  46.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  38.37 
 
 		 537 aa  46.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 440 aa  46.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5191  hypothetical protein  37.7 
 
 		 278 aa  46.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 1177 aa  46.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 1271 aa  46.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  23.1 
 
 		 641 aa  46.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 		 354 aa  46.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 452 aa  45.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  21.84 
 
 		 1673 aa  45.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 1265 aa  45.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 1177 aa  45.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 369 aa  45.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 		 354 aa  45.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 733 aa  45.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 390 aa  45.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  21.78 
 
 		 415 aa  45.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  29.76 
 
 		 736 aa  45.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 379 aa  45.1  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>