More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4705 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 440 aa  898    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  66.97 
 
 		 440 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  51.31 
 
 		 425 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  51.56 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  42.34 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  43.11 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  37.62 
 
 		 413 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  37.05 
 
 		 413 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  26.74 
 
 		 778 aa  138  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 447 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 539 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 733 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 782 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  27.19 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  27.24 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 466 aa  86.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 924 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.82 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  25.66 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.18 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  19.76 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.22 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.51 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 353 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 349 aa  69.7  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  23.24 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  26.88 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 381 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  24.14 
 
 		 346 aa  67  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 660 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.34 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  28.97 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.89 
 
 		 1867 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>