More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0472 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
424 aa  839    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  83.17 
 
 
422 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  64.62 
 
 
423 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  64.37 
 
 
423 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  62.3 
 
 
424 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  66.09 
 
 
421 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  39.8 
 
 
422 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  41.43 
 
 
434 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  40.77 
 
 
443 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  40.92 
 
 
420 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  40.55 
 
 
421 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
448 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 
431 aa  156  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
414 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
415 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.77 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  31.52 
 
 
384 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
394 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  31.4 
 
 
401 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
391 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
390 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
403 aa  103  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
426 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
426 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
403 aa  100  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
392 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
445 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
403 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  27.29 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
539 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  41.51 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  41.51 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
704 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  28.57 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.37 
 
 
778 aa  79  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  40.76 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0856  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.609442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.87 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
816 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2498  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  39.22 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0628  glycosyltransferase  29.94 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.91 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0807  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.64262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0643  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.94 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  29.35 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
733 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  29.08 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  33.15 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04491  putative glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  28.52 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>