More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6490 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1125  glycosyl transferase group 1  98.07 
 
 
414 aa  834    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6490  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
414 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632954  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.88 
 
 
398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0643  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.37 
 
 
398 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0807  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.37 
 
 
398 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.64262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.12 
 
 
398 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2498  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.12 
 
 
398 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.12 
 
 
398 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.12 
 
 
398 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0628  glycosyltransferase  49.88 
 
 
398 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  47.44 
 
 
396 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  47.44 
 
 
396 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  47.44 
 
 
396 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0856  glycosyl transferase group 1  44.33 
 
 
406 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.609442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0848  glycosyl transferase group 1  44.21 
 
 
390 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4404  glycosyl transferase group 1  46.07 
 
 
396 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983503  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
387 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
410 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
390 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
733 aa  73.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  25.32 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  21.59 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  28.16 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
358 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
431 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
398 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
356 aa  63.5  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
455 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.14 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2939  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
406 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  30.7 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  31.55 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.11 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  31.55 
 
 
382 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.7 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 
379 aa  60.5  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
424 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
445 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
428 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
409 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  31.58 
 
 
393 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
414 aa  59.7  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  29.06 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  30.77 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
409 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
409 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
462 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
389 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  29.29 
 
 
382 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
357 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  28.46 
 
 
442 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 
427 aa  56.6  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.42 
 
 
778 aa  56.6  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
435 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
407 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
387 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>