182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2864 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2864  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
382 aa  802    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2863  glycosyl transferase group 1  69.53 
 
 
400 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
401 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.75 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
403 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  30.08 
 
 
403 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.67 
 
 
397 aa  156  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
397 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  24.21 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  23.63 
 
 
414 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  22.13 
 
 
539 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 
440 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
410 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
385 aa  57.4  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  23.86 
 
 
350 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  23.08 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 
396 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0459  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000538339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
402 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  22.22 
 
 
425 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
393 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  21.5 
 
 
452 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 
440 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  23.11 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
393 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  22.63 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  23.84 
 
 
403 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
349 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  21.95 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  30 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0141  glycosyl transferase, group 1  23.22 
 
 
374 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191109  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
391 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1801  glycosyltransferase  26.45 
 
 
309 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0795  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  20.49 
 
 
1147 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0612  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
369 aa  49.7  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  25.28 
 
 
406 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  25 
 
 
401 aa  49.7  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.12 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3449  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455826  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1327  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0360099  hitchhiker  0.00101866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
1303 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
344 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1435  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429378  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.09 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12651  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
362 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
464 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0891  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
397 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2759  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 
348 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0642938  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
403 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
403 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
453 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1914  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
435 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
402 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  30.56 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  20.3 
 
 
413 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
353 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2681  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
423 aa  46.2  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
364 aa  46.2  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.24 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>