37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2276 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2276  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
447 aa  895    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0256  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.09 
 
 
355 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0330  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
394 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
425 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
419 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
358 aa  47  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
375 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
358 aa  46.6  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
538 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
380 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
409 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  28.98 
 
 
382 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
366 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
389 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4987  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
363 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  29.63 
 
 
550 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
394 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>