More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2007 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2007  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 355 aa  727    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.909403  normal  0.304999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2402  glycosyl transferase group 1  98.31 
 
 		 355 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.923464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  49 
 
 		 358 aa  341  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1199  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  48.15 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1208  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  48.15 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1911  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  48.15 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0329  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  48.15 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1358  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  48.15 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1046  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  48.15 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0822  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  48.15 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0986  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  47.77 
 
 		 363 aa  339  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3923  glycosyl transferase group 1  47.16 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1256  glycosyl transferase group 1  46.7 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121425  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  22.86 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.45 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  28 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  23.53 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0696  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  21.56 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  22.45 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  30.99 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  26.27 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0779  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1141  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.24 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  26.85 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  22.04 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  22.35 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 405 aa  57  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  27.84 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 850 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  24.32 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  28.3 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.92 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.27 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 439 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  28.49 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1440  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.185476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.14 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1763  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.656807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1010  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156875  hitchhiker  0.0000000000138079 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.19 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 404 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.52 
 
 		 857 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  27.94 
 
 		 480 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>