More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1256 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1256  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
358 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121425  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  86.87 
 
 
358 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1911  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68 
 
 
360 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1358  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68 
 
 
379 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0329  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68 
 
 
360 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1046  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68 
 
 
360 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0822  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68 
 
 
360 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1199  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68 
 
 
360 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1208  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68 
 
 
360 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0986  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  68.82 
 
 
363 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3923  glycosyl transferase group 1  66.86 
 
 
356 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2402  glycosyl transferase group 1  47.14 
 
 
355 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.923464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2007  glycosyl transferase group 1  46.7 
 
 
355 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.909403  normal  0.304999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
375 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
448 aa  85.9  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  31.16 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  27.35 
 
 
424 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.57 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  26.56 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0779  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  29.89 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.61 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  29.35 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  32.76 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  32.77 
 
 
450 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.72 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  26.88 
 
 
427 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  31.84 
 
 
466 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
342 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  32.06 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.95 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.75 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.05 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
396 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  25.53 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  21.56 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.84 
 
 
404 aa  63.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.44 
 
 
443 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  30.29 
 
 
443 aa  62.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  28.44 
 
 
434 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.53 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.21 
 
 
431 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  25.89 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  24.24 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.3 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
404 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
439 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
426 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
424 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
417 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
443 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
443 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
495 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
498 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
499 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
443 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>