More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1358 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1911  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  99.44 
 
 
360 aa  714    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1358  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  100 
 
 
379 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1208  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  100 
 
 
360 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0329  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  99.44 
 
 
360 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1046  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  99.44 
 
 
360 aa  714    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0822  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  99.44 
 
 
360 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1199  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  100 
 
 
360 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0986  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  90.2 
 
 
363 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3923  glycosyl transferase group 1  69.1 
 
 
356 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  68.86 
 
 
358 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1256  glycosyl transferase group 1  68 
 
 
358 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121425  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2402  glycosyl transferase group 1  48.43 
 
 
355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.923464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2007  glycosyl transferase group 1  48.15 
 
 
355 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.909403  normal  0.304999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
378 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.14 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  26.07 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  22.29 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.72 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  24.49 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  21.79 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  25.4 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  25.64 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.5 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.43 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  28 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  21.14 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  24.4 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  26.2 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
434 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
396 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
390 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
371 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
373 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0659  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
397 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  25.76 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  32.57 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
432 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
448 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  25.9 
 
 
450 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.78 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
394 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.78 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  23.78 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
448 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
409 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
372 aa  60.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
409 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
402 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.73 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.12 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
415 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  25.06 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.65 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  29.82 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>