46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0148 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0148  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
380 aa  781    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3551  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
371 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.185108  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
703 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1410  glycosyl transferase, group 1  22.16 
 
 
384 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0610  glycosyl transferase, family 1  25.25 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2777  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
406 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0709  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.61 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.91 
 
 
371 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.26 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2440  glycosyltransferase  25.56 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
1264 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
387 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
370 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 
699 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  22.93 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  26.2 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  21.83 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
425 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  29.48 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1139  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
756 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4369  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00420943  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  25.74 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  46.81 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  26.45 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3285  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
325 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514132  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
384 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.52 
 
 
491 aa  43.5  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12651  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
461 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.88 
 
 
373 aa  43.1  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.58 
 
 
490 aa  42.7  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  23.86 
 
 
366 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
385 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>