More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3551 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3551  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
371 aa  770    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.185108  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0148  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
380 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
703 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  26.91 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
643 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.13 
 
 
643 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.13 
 
 
643 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.55 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.78 
 
 
643 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
1264 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
699 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  23.95 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2576  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731131  normal  0.452849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  26.69 
 
 
468 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2777  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  26.01 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
388 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
389 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
387 aa  62.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
1247 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
461 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  25.75 
 
 
820 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  25.16 
 
 
399 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
375 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
365 aa  59.7  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
385 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  26.16 
 
 
820 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1322  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.89 
 
 
856 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.89 
 
 
856 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  25.67 
 
 
820 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
821 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
821 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
821 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.89 
 
 
820 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  25.89 
 
 
820 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.89 
 
 
820 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
390 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
821 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
390 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  24.38 
 
 
383 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
365 aa  56.2  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1588  glycosyltransferase  22.75 
 
 
347 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2839  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000929043  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0847  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
470 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
818 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.31 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.9 
 
 
381 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
821 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
416 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  24.71 
 
 
365 aa  53.9  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.9 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.9 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.9 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.9 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.9 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
1991 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
828 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
425 aa  53.5  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.48 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
372 aa  53.1  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
372 aa  53.1  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 
743 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
385 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.9 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.9 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
390 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  26.36 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
665 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
819 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3930  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
375 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
375 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
367 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
372 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>