41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0205 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  96.85 
 
 
222 aa  436  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  85 
 
 
239 aa  387  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  39.78 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  31.89 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  31.32 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  31.32 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  31.32 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
1334 aa  58.9  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  27.75 
 
 
252 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  27.78 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  24.86 
 
 
518 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0250  hypothetical protein  27.63 
 
 
97 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0188439  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  25.67 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3032  hypothetical protein  41.94 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.25 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0113  hypothetical protein  27.51 
 
 
260 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119878  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  25 
 
 
245 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  24.47 
 
 
557 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1814  hypothetical protein  23.35 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  31.34 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1764  hypothetical protein  23.35 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1585  hypothetical protein  23.35 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1613  hypothetical protein  23.35 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1635  hypothetical protein  23.35 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0150544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  28.19 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3565  hypothetical protein  21.88 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.876515  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  25.37 
 
 
204 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
1152 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1779  hypothetical protein  21.23 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0835  hypothetical protein  23.74 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2733  glycosyltransferase-like protein  24.65 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  25.9 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1839  hypothetical protein  24.14 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1893  hypothetical protein  23.02 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00821908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1634  hypothetical protein  24.42 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257483  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 
1084 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1486  hypothetical protein  35 
 
 
477 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  22.36 
 
 
1236 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34902  predicted protein  39.22 
 
 
291 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>