30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3869 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  62.63 
 
 		 212 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  60.29 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  57 
 
 		 224 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  52.44 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  52.44 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  55.83 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  52.44 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  57.92 
 
 		 205 aa  231  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  56.92 
 
 		 231 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  53.02 
 
 		 222 aa  224  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  53 
 
 		 210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  55.44 
 
 		 190 aa  214  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  50.72 
 
 		 210 aa  211  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  52.76 
 
 		 204 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  51.05 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  49.74 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  54.23 
 
 		 205 aa  188  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  44.06 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  43.59 
 
 		 204 aa  168  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  38.61 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  29.41 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 243 aa  45.1  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2175  hypothetical protein  24.48 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 956 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  30.88 
 
 		 216 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  30.88 
 
 		 216 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  30.88 
 
 		 216 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 1476 aa  41.6  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>