26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2490 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  56.78 
 
 		 200 aa  232  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  52.76 
 
 		 204 aa  228  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  54.92 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  55.9 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  54.87 
 
 		 222 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  54.4 
 
 		 231 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  51.28 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  50.52 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  48.21 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  51.02 
 
 		 227 aa  201  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  52.76 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  51.53 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  50.79 
 
 		 223 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  50.79 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  50.79 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  50 
 
 		 190 aa  191  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  50.51 
 
 		 205 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  48.04 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  36.16 
 
 		 267 aa  98.6  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  30.59 
 
 		 378 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  25.68 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3358  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1049 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  25.31 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>