22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2796 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  69.57 
 
 
231 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  63.94 
 
 
210 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  61.06 
 
 
210 aa  254  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  59.9 
 
 
210 aa  248  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  60.66 
 
 
212 aa  244  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  59.72 
 
 
223 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  59.72 
 
 
223 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  59.72 
 
 
223 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  62 
 
 
205 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  57.01 
 
 
227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  56.5 
 
 
224 aa  228  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  53.02 
 
 
233 aa  224  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  60.42 
 
 
190 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  54.87 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  52 
 
 
200 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  59.42 
 
 
205 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  59.57 
 
 
235 aa  204  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  49.23 
 
 
204 aa  187  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  44.1 
 
 
209 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  38.16 
 
 
267 aa  108  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4298  O-methyltransferase family protein  30 
 
 
221 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>