21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0492 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  43.28 
 
 
205 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  41.24 
 
 
209 aa  131  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  40.1 
 
 
210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  40.3 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  40.3 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  40.3 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  38.61 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  39.41 
 
 
231 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  38.38 
 
 
210 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  42.93 
 
 
190 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  40.72 
 
 
210 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  41 
 
 
224 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  40.5 
 
 
227 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  38.54 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  41.84 
 
 
205 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  38.27 
 
 
200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  36.08 
 
 
204 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  41.18 
 
 
235 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  38.16 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  36.16 
 
 
204 aa  98.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>