32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8251 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  80 
 
 
210 aa  328  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  72.33 
 
 
231 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  62.25 
 
 
210 aa  265  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  63.94 
 
 
222 aa  264  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  63.9 
 
 
212 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  59.11 
 
 
223 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  59.11 
 
 
223 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  59.11 
 
 
223 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  58.54 
 
 
227 aa  242  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  60.94 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  60.49 
 
 
205 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  60.53 
 
 
190 aa  235  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  58.92 
 
 
235 aa  218  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  60 
 
 
205 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  50.72 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  53.12 
 
 
200 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  50.52 
 
 
204 aa  204  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  47.29 
 
 
204 aa  192  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  45.18 
 
 
209 aa  185  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  40.72 
 
 
267 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  30.19 
 
 
378 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  26.47 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0328  hypothetical protein  40.98 
 
 
235 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  29.79 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  29.79 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  29.79 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  31.33 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0835  hypothetical protein  51.35 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1634  hypothetical protein  45.95 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1779  hypothetical protein  45.95 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3565  hypothetical protein  45.95 
 
 
219 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.876515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>