34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0387 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  69.05 
 
 		 210 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  63.9 
 
 		 210 aa  273  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  63.24 
 
 		 210 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  62.14 
 
 		 223 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  62.14 
 
 		 223 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  62.14 
 
 		 223 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  61.06 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  63.5 
 
 		 224 aa  261  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  62.98 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  62.98 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  63.68 
 
 		 205 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  60.66 
 
 		 222 aa  254  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  58.42 
 
 		 190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  54.59 
 
 		 204 aa  225  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  57.84 
 
 		 235 aa  221  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  55.96 
 
 		 200 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  59.2 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  49.24 
 
 		 209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  48.44 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  38.19 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  29.32 
 
 		 378 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2175  hypothetical protein  29.08 
 
 		 252 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  29.33 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0328  hypothetical protein  41.18 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  30.15 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  30.15 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  30.15 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  25.5 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  27.52 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 1334 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  28 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3689  hypothetical protein  39.13 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0452  O-methyltransferase family 3  22.39 
 
 		 346 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>