27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3597 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  64.18 
 
 
205 aa  249  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  59.2 
 
 
210 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  61.66 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  58.03 
 
 
212 aa  242  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  56.93 
 
 
210 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  63.68 
 
 
190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  56.93 
 
 
227 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  60.59 
 
 
222 aa  228  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  56.35 
 
 
224 aa  224  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  55 
 
 
210 aa  225  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  56 
 
 
223 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  53.2 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  56 
 
 
223 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  56 
 
 
223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  60.1 
 
 
205 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  48.96 
 
 
200 aa  194  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  44.55 
 
 
209 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  48.96 
 
 
204 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  46.15 
 
 
204 aa  182  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  41.35 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  30.56 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  30.56 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  30.56 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  27.27 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  25.4 
 
 
378 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
1334 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>