20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2745 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  767    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  31.89 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  31.02 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  31.97 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  30.19 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  29.63 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  30.73 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  30.59 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  29.67 
 
 		 212 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  26.16 
 
 		 204 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  26.32 
 
 		 210 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  27.72 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  26.92 
 
 		 223 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  26.44 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  26.44 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  23.12 
 
 		 209 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>