29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2587 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  52.76 
 
 		 204 aa  228  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  50.75 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  49.74 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  48.44 
 
 		 212 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  49.23 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  49.48 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  47.29 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  46.91 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  47.12 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  47.12 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  49.23 
 
 		 222 aa  187  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  47.18 
 
 		 227 aa  184  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  48.17 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  45.59 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  47.09 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  43.81 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  48.88 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  43.59 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  44.27 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  36.08 
 
 		 267 aa  112  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  27.74 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  26.47 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  26.16 
 
 		 378 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  24.63 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  25.37 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  29.55 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  29.55 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  29.55 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>