30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0009 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  413  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  82.54 
 
 		 190 aa  317  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  67.32 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  66.84 
 
 		 231 aa  256  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  61.27 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  61.73 
 
 		 223 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  61.73 
 
 		 223 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  60 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  61.73 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  59.41 
 
 		 227 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  58.55 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  58 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  59.42 
 
 		 222 aa  232  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  57.79 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  55.22 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  59.46 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  50.51 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  50.78 
 
 		 200 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  44.27 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  42.64 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  41.84 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37392  predicted protein  31.79 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000419488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  28.33 
 
 		 378 aa  44.7  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3689  hypothetical protein  44.74 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3358  hypothetical protein  27.22 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0019  O-methyltransferase family protein  31.41 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0452  O-methyltransferase family 3  26.03 
 
 		 346 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0073  O-methyltransferase family 3  24.65 
 
 		 211 aa  42  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  30.5 
 
 		 222 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0176  O-methyltransferase family 3  27.75 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>