16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3358 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3358  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0452  O-methyltransferase family 3  25.44 
 
 
346 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  30.17 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  30.17 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  30.17 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0113  hypothetical protein  31.54 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119878  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1961  O-methyltransferase family 3  34.78 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.282788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  29.38 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2893  hypothetical protein  28.41 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47175  predicted protein  29.89 
 
 
369 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1028  O-methyltransferase family protein  25.52 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34902  predicted protein  45.45 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  27.04 
 
 
204 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  26.19 
 
 
518 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47174  predicted protein  27.34 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2733  glycosyltransferase-like protein  25.2 
 
 
329 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>