26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1486 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1486  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  988    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  42.67 
 
 
614 aa  194  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  37.05 
 
 
2046 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0375  hypothetical protein  29.17 
 
 
268 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
1770 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  41.38 
 
 
243 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5154  hypothetical protein  24.79 
 
 
223 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  28.89 
 
 
642 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1123  hypothetical protein  23.73 
 
 
268 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0447  glycosyltransferase-like protein  29.51 
 
 
264 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1855  glycosyltransferase-like protein  30.16 
 
 
258 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1231  hypothetical protein  22.57 
 
 
235 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0452  O-methyltransferase family 3  26.09 
 
 
346 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1350  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1028  O-methyltransferase family protein  26.09 
 
 
258 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2180  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3249  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1073  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.110982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0526  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2588  SAM-dependent methyltransferase; O-methyltransferase  24.39 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3297  WcbF  21.71 
 
 
498 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  36.67 
 
 
239 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3284  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 
427 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32234  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1961  O-methyltransferase family 3  24.84 
 
 
264 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.282788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1093  O-methyltransferase family 3  27.61 
 
 
219 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1889  O-methyltransferase  27.48 
 
 
227 aa  43.1  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>