25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3297 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3297  WcbF  100 
 
 
498 aa  1032    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3284  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  98.59 
 
 
427 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3249  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  99.06 
 
 
427 aa  878    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1073  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  99.35 
 
 
459 aa  944    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.110982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0526  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  99.35 
 
 
459 aa  944    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2180  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  99.35 
 
 
459 aa  944    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0733  hypothetical protein  24.49 
 
 
495 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0745  hypothetical protein  32.86 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.570751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2662  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1410  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2574  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3178  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2136  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1634  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2521  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0855  hypothetical protein  28.74 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.635921  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1957  hypothetical protein  27.86 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0748  hypothetical protein  24.7 
 
 
897 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  25.1 
 
 
2046 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
614 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0743  hypothetical protein  25.48 
 
 
319 aa  54.3  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2302  hypothetical protein  21.45 
 
 
275 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0195  hypothetical protein  25.6 
 
 
378 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4223  hypothetical protein  26.02 
 
 
417 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1486  hypothetical protein  29.67 
 
 
477 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>