26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0855 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0855  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  548  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.635921  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0743  hypothetical protein  28.89 
 
 
319 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3284  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 
427 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3297  WcbF  28.74 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2180  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3249  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1073  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.110982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0526  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  29.39 
 
 
2046 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1952  hypothetical protein  29.14 
 
 
335 aa  72  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2574  hypothetical protein  25.74 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2521  hypothetical protein  25.74 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2662  hypothetical protein  25.74 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2136  hypothetical protein  24.36 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3178  hypothetical protein  24.36 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1957  hypothetical protein  23.14 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1410  hypothetical protein  24.36 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1634  hypothetical protein  24.36 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0745  hypothetical protein  25.31 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.570751  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  28.51 
 
 
614 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0733  hypothetical protein  26.32 
 
 
495 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0748  hypothetical protein  24.39 
 
 
897 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2302  hypothetical protein  25 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00969  hypothetical protein  25.4 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4223  hypothetical protein  23.61 
 
 
417 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18661  predicted protein  28.66 
 
 
402 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0495806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>