27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A3178 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1634  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1410  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3178  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2136  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2662  hypothetical protein  99.62 
 
 
265 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2574  hypothetical protein  99.25 
 
 
265 aa  533  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2521  hypothetical protein  98.49 
 
 
265 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1957  hypothetical protein  89.81 
 
 
265 aa  480  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0748  hypothetical protein  30.04 
 
 
897 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0733  hypothetical protein  29.43 
 
 
495 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3284  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 
427 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3249  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1073  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.110982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2180  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0526  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615535  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0743  hypothetical protein  28.33 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3297  WcbF  29.39 
 
 
498 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0855  hypothetical protein  23.28 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.635921  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  22.17 
 
 
614 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5154  hypothetical protein  24.8 
 
 
223 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0745  hypothetical protein  26.67 
 
 
435 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.570751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0195  hypothetical protein  22.41 
 
 
378 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1952  hypothetical protein  23.85 
 
 
335 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  28 
 
 
445 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1231  hypothetical protein  26.67 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2302  hypothetical protein  31.07 
 
 
275 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
2046 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>