13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1952 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1952  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  696    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0855  hypothetical protein  30.36 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.635921  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0743  hypothetical protein  27.12 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4223  hypothetical protein  25.15 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1957  hypothetical protein  23.93 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50468  predicted protein  34.62 
 
 		 440 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1634  hypothetical protein  23.85 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2136  hypothetical protein  23.85 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3178  hypothetical protein  23.85 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1410  hypothetical protein  23.85 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2662  hypothetical protein  25.13 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2574  hypothetical protein  25.13 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2521  hypothetical protein  25.27 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>