16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4223 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4223  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  859    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0745  hypothetical protein  24.78 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.570751  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4707  putative membrane-anchored protein  37.68 
 
 		 235 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3431  putative membrane-anchored protein  37.31 
 
 		 256 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3284  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0526  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1073  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.110982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2180  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 958 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1952  hypothetical protein  25.15 
 
 		 335 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3297  WcbF  26.02 
 
 		 498 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 537 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3249  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1449 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2784  hypothetical protein  31.13 
 
 		 195 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.188398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3995  hypothetical protein  34.78 
 
 		 720 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.45798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>