22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4707 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4707  putative membrane-anchored protein  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3431  putative membrane-anchored protein  58.67 
 
 		 256 aa  258  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  45.33 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  45.33 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  37.33 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 		 958 aa  52.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2784  hypothetical protein  32.41 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.188398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  34.29 
 
 		 363 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1122  hypothetical protein  32.41 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5191  hypothetical protein  40.32 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3989  hypothetical protein  38.6 
 
 		 490 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.572227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1449 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  33.85 
 
 		 537 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3238  hypothetical protein  34.88 
 
 		 296 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 720 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  32.35 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 		 1400 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.94 
 
 		 809 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4404  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.31 
 
 		 456 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 880 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 808 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>