79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2282 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  914    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  85.8 
 
 		 418 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  61.97 
 
 		 283 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  49.15 
 
 		 363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  39.24 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  48.92 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  51.16 
 
 		 516 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  49.46 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  47.64 
 
 		 460 aa  159  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  48.11 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  47.09 
 
 		 1050 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  41.75 
 
 		 499 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  42.86 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  47.31 
 
 		 594 aa  150  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  45.74 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  38.72 
 
 		 342 aa  144  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  35.67 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  43.32 
 
 		 346 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  43.01 
 
 		 641 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  43.33 
 
 		 743 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  43.01 
 
 		 465 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  42.78 
 
 		 266 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  42.78 
 
 		 266 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  45.25 
 
 		 848 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  40.65 
 
 		 273 aa  124  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  30.79 
 
 		 738 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  41.94 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  29.91 
 
 		 644 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.27 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  31.02 
 
 		 792 aa  103  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  37.65 
 
 		 1503 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 		 561 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  34.52 
 
 		 220 aa  98.2  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  35.03 
 
 		 232 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  37.14 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  40.56 
 
 		 207 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  34.78 
 
 		 833 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  33.16 
 
 		 322 aa  90.9  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  40.56 
 
 		 207 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  32.97 
 
 		 1462 aa  90.1  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  38.3 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  32.16 
 
 		 387 aa  87.8  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  35.66 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  30.66 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  34.97 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  32.58 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  33.47 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  37.41 
 
 		 351 aa  83.2  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  33.16 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  30.53 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  38.24 
 
 		 950 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  34.25 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  36.36 
 
 		 356 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  29.41 
 
 		 1043 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  32.88 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  32.88 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  40 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  37.5 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  62 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4707  putative membrane-anchored protein  45.33 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617832 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  30.67 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  42.65 
 
 		 958 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  32.87 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5191  hypothetical protein  41.98 
 
 		 278 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  32.93 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  32.43 
 
 		 854 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  36.3 
 
 		 826 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  32.29 
 
 		 227 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3431  putative membrane-anchored protein  34.31 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  36.47 
 
 		 1449 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 		 1383 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3322  hypothetical protein  38.52 
 
 		 506 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.213782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  26.39 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  35.35 
 
 		 726 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  32.95 
 
 		 230 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.33 
 
 		 714 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1159  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>