77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5751 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  703    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  49.21 
 
 		 418 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  44.63 
 
 		 452 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  43.79 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  41.2 
 
 		 447 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  55.78 
 
 		 516 aa  149  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  53.55 
 
 		 469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  47.57 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  48.88 
 
 		 346 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  39.66 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  51.48 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  46.11 
 
 		 346 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  48.44 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  45.5 
 
 		 493 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  52.32 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  47.15 
 
 		 641 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  39.58 
 
 		 460 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  40 
 
 		 1050 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  47.76 
 
 		 594 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  39.47 
 
 		 743 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  38.41 
 
 		 273 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  39.34 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  37.37 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  45.62 
 
 		 848 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  37.37 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  40.32 
 
 		 738 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  33.66 
 
 		 644 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 589 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  35.14 
 
 		 792 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  36.96 
 
 		 212 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  36.06 
 
 		 232 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  35.98 
 
 		 207 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  38.97 
 
 		 292 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  35.98 
 
 		 207 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  41.01 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  38.26 
 
 		 833 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  33.16 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  32.52 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  39.04 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  34.48 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  38.93 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  38.35 
 
 		 1503 aa  80.5  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  39.04 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  39.58 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  34.01 
 
 		 1462 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  33.33 
 
 		 950 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  29.49 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  34.46 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  34.36 
 
 		 530 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  35.71 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  41.32 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  33.09 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  31.53 
 
 		 1043 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  37.84 
 
 		 227 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  41.1 
 
 		 537 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  34.84 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  35.46 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  30.34 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  37.14 
 
 		 537 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  31.69 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  30 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  34.23 
 
 		 854 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  30.77 
 
 		 767 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4707  putative membrane-anchored protein  34.29 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  32.05 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 958 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1449 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3995  hypothetical protein  42.86 
 
 		 720 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  27.56 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5191  hypothetical protein  35.53 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2784  hypothetical protein  35.71 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.188398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3322  hypothetical protein  40.51 
 
 		 506 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.213782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1122  hypothetical protein  34.41 
 
 		 195 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 		 1400 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  28.89 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>