25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3284 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3297  WcbF  98.59 
 
 
498 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3284  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
427 aa  887    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3249  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  99.06 
 
 
427 aa  876    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1073  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  98.36 
 
 
459 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.110982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2180  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  98.36 
 
 
459 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0526  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  98.36 
 
 
459 aa  869    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615535  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0733  hypothetical protein  24.36 
 
 
495 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0745  hypothetical protein  32.86 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.570751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1410  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1634  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3178  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2136  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2662  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2574  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2521  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1957  hypothetical protein  28.24 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0855  hypothetical protein  29.13 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.635921  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0748  hypothetical protein  24.76 
 
 
897 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  24.7 
 
 
2046 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  23.28 
 
 
614 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0743  hypothetical protein  25.38 
 
 
319 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2302  hypothetical protein  21.45 
 
 
275 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4223  hypothetical protein  26.32 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0195  hypothetical protein  25.6 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1486  hypothetical protein  30.85 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>