30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0748 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0748  hypothetical protein  100 
 
 
897 aa  1860    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0733  hypothetical protein  47.24 
 
 
495 aa  389  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0745  hypothetical protein  26.37 
 
 
435 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.570751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1957  hypothetical protein  30.66 
 
 
265 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2662  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3178  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1410  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1634  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2136  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2521  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2574  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0749  hypothetical protein  31.95 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0743  hypothetical protein  27.65 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1094  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0202468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1574  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1550  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000520651  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3249  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
427 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3284  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.32234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3297  WcbF  24.34 
 
 
498 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3966  hypothetical protein  32.93 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0526  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
459 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1073  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
459 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.110982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2180  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
459 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0195  hypothetical protein  23.12 
 
 
378 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2969  hypothetical protein  31.02 
 
 
271 aa  61.2  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.680381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2584  hypothetical protein  31.02 
 
 
258 aa  60.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0855  hypothetical protein  24.39 
 
 
267 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.635921  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4150  hypothetical protein  32.29 
 
 
267 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.287277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02447  phenylalanyl-tRNA synthetase alpha subunit  26.03 
 
 
277 aa  44.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0850971  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32186  predicted protein  29.01 
 
 
610 aa  44.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.420674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>