10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2584 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2584  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.680381  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0749  hypothetical protein  46.88 
 
 		 296 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3966  hypothetical protein  43.58 
 
 		 472 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1094  hypothetical protein  40.08 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0202468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1574  hypothetical protein  40.08 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1550  hypothetical protein  40.08 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000520651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0910  hypothetical protein  38.64 
 
 		 120 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0748  hypothetical protein  31.02 
 
 		 897 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3962  hypothetical protein  25.43 
 
 		 396 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.126787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>