10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3966 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3966  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  969    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0749  hypothetical protein  54.41 
 
 		 296 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1094  hypothetical protein  45.85 
 
 		 356 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0202468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1574  hypothetical protein  45.85 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1550  hypothetical protein  45.85 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000520651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2969  hypothetical protein  43.58 
 
 		 271 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.680381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2584  hypothetical protein  43.58 
 
 		 258 aa  223  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3962  hypothetical protein  28.72 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.126787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0910  hypothetical protein  49.38 
 
 		 120 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0748  hypothetical protein  32.93 
 
 		 897 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>