36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12973 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  100 
 
 
245 aa  510  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  38.76 
 
 
210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  38.28 
 
 
210 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  38.28 
 
 
210 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  38.57 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  38.66 
 
 
191 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  40.12 
 
 
170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  38.37 
 
 
170 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  38.95 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  39.05 
 
 
166 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  39.05 
 
 
166 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  33.64 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  31.4 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  31.88 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  31.25 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  30.33 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  31.22 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  29.95 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  28.85 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  27.67 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  27.4 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  30.3 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000070397  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  30.7 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  27.27 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  29.19 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1845  cephalosporin hydroxylase  29.5 
 
 
584 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  26.92 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  26.25 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  26.25 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  25.93 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  26.48 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1367  cephalosporin hydroxylase  28.78 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2626  hypothetical protein  23.49 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  24.21 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  25.15 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>