31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1516 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  69.71 
 
 		 244 aa  361  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  59.07 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  58.08 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  53.78 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  51.11 
 
 		 270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  53.6 
 
 		 259 aa  261  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  56.76 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  49 
 
 		 255 aa  242  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000070397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  46.53 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  44.03 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  48.25 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  47.37 
 
 		 252 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  43.78 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  41.94 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  42.4 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  42.4 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  41.01 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  44.16 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  40.2 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  40.2 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  39.71 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  41.92 
 
 		 191 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  40.2 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  42.31 
 
 		 170 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  41.21 
 
 		 170 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  42.31 
 
 		 170 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  40.56 
 
 		 166 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  40.56 
 
 		 166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  33.64 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1367  cephalosporin hydroxylase  30.77 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>