31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3346 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  44.78 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  43.61 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  45.81 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  40.62 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  37.2 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  38.84 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  38.4 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000070397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  42.72 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  45.95 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  44.86 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  40 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  40.53 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  39.7 
 
 		 229 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  39.7 
 
 		 229 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  38.67 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  39.2 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  38.61 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  38.95 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  40.86 
 
 		 210 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  40.86 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  40.86 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  40.11 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  39.78 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  38.92 
 
 		 170 aa  118  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  38.92 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  39.52 
 
 		 170 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  39.26 
 
 		 166 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  39.26 
 
 		 166 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  31.25 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1845  cephalosporin hydroxylase  26.21 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>