30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6315 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1764  cephalosporin hydroxylase  100 
 
 
229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6315  cephalosporin hydroxylase  100 
 
 
229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5062  cephalosporin hydroxylase  93.01 
 
 
229 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1777  cephalosporin hydroxylase  95.93 
 
 
221 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.836048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1699  cephalosporin hydroxylase  91.4 
 
 
221 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0146092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3713  cephalosporin hydroxylase  41.67 
 
 
244 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1965  cephalosporin hydroxylase  42.62 
 
 
260 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1516  cephalosporin hydroxylase  42.4 
 
 
242 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894097  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3055  cephalosporin hydroxylase  38.11 
 
 
259 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.52398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4505  Cephalosporin hydroxylase  41.82 
 
 
250 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280491  normal  0.539468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0632  cephalosporin protein  37.6 
 
 
270 aa  178  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4414  cephalosporin hydroxylase  40.35 
 
 
259 aa  174  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27730  cephalosporin hydroxylase  38.36 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4503  Cephalosporin hydroxylase  40.1 
 
 
252 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0207174  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4212  Cephalosporin hydroxylase  39.13 
 
 
252 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0597  cephalosporin hydroxylase  36.71 
 
 
256 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4184  Cephalosporin hydroxylase  39.91 
 
 
250 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0054  hypothetical protein  34.48 
 
 
255 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000070397  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3346  cephalosporin hydroxylase  38.92 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190282  normal  0.507049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3111  hypothetical protein  31.88 
 
 
210 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0541974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3085  hypothetical protein  31.88 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2870  hypothetical protein  31.88 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.597368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2800  cephalosporin hydroxylase  32.68 
 
 
210 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2840  cephalosporin hydroxylase  30.88 
 
 
191 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3078  hypothetical protein  30.11 
 
 
170 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2862  cephalosporin hydroxylase  30.65 
 
 
170 aa  89  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2157  hypothetical protein  30.65 
 
 
170 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3091  hypothetical protein  30.43 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3110  hypothetical protein  30.43 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.215479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12973  methyltransferase  26.25 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>