12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0456 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0456  surface array protein  100 
 
 
1164 aa  2184    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0462  surface array protein  55.86 
 
 
1106 aa  1010    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0464  surface array protein  62.04 
 
 
1257 aa  1048    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0478  surface layer protein SapA12  55.68 
 
 
1109 aa  968    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0486  surface array protein  55.86 
 
 
1106 aa  1010    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0490  surface array protein  67.65 
 
 
1292 aa  1200    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.799434  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0484  hypothetical protein  84.96 
 
 
939 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0960554  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0461  surface layer protein SapB9  83 
 
 
941 aa  399  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0481  surface array protein  74.07 
 
 
921 aa  399  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18804  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  28.52 
 
 
1037 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  41.1 
 
 
1313 aa  49.7  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.64 
 
 
862 aa  45.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>