15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0462 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0456  surface array protein  56.14 
 
 
1164 aa  1030    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0462  surface array protein  100 
 
 
1106 aa  2080    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0464  surface array protein  62.09 
 
 
1257 aa  995    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0478  surface layer protein SapA12  86.88 
 
 
1109 aa  1686    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0486  surface array protein  100 
 
 
1106 aa  2080    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0490  surface array protein  53.73 
 
 
1292 aa  800    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.799434  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0484  hypothetical protein  85.37 
 
 
939 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0960554  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0461  surface layer protein SapB9  85.37 
 
 
941 aa  399  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0481  surface array protein  69.3 
 
 
921 aa  396  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18804  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  28.19 
 
 
1037 aa  86.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  44.32 
 
 
1313 aa  53.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  24.85 
 
 
2178 aa  52  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1726  hemolysin-type calcium-binding region  31.08 
 
 
1144 aa  45.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.57086  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.64 
 
 
862 aa  45.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  32.86 
 
 
424 aa  45.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>