11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1726 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1726  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
1144 aa  2112    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.57086  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3840  hemolysin-type calcium-binding region  35.38 
 
 
1093 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0668693 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1716  hemolysin-type calcium-binding region  37.94 
 
 
929 aa  127  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.852019  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  32.7 
 
 
1083 aa  67.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0484  hypothetical protein  31.31 
 
 
939 aa  57.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0960554  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  38.64 
 
 
830 aa  52.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  41.59 
 
 
2178 aa  51.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0461  surface layer protein SapB9  41.33 
 
 
941 aa  49.7  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0481  surface array protein  41.03 
 
 
921 aa  49.3  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18804  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0462  surface array protein  31.29 
 
 
1106 aa  44.7  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0486  surface array protein  31.29 
 
 
1106 aa  44.7  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>