201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2785 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2785  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 		 341 aa  703    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0917922  hitchhiker  0.00370167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1802  hypothetical protein  78.84 
 
 		 339 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  68.56 
 
 		 306 aa  461  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  68.2 
 
 		 324 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  67.54 
 
 		 324 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  66.11 
 
 		 345 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1627  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  67.45 
 
 		 335 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  66.11 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2081  hypothetical protein  62.01 
 
 		 313 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  50 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  48.38 
 
 		 330 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  50 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  42.77 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  47.99 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  47.99 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  47.99 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  47.65 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  47.65 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  47.32 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  47.32 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  47.32 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  47.32 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  47.32 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.65 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  47.32 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  47.65 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  46.98 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.18 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  46.98 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.97 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  45.67 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  42.9 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  44.83 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.12 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.22 
 
 		 333 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  33.45 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.89 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.89 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.89 
 
 		 366 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  29.94 
 
 		 392 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  27.03 
 
 		 445 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1613  hypothetical protein  26.74 
 
 		 426 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144608  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3037  hypothetical protein  25.96 
 
 		 433 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.1 
 
 		 348 aa  89.7  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.84 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.15 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.37 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.74 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.84 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0163  hypothetical protein  24.48 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.51 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  28.05 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  24.32 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.89 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  22.71 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.65 
 
 		 689 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.31 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.31 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.78 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.99 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  26.94 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.65 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.5 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.5 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.15 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  23.31 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.15 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.77 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.37 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  25.25 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  26.01 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1667 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.73 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.38 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.06 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.07 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.92 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.29 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.15 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.15 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  20.85 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.5 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.26 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.7 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.83 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.26 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.26 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.28 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.67 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.73 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.58 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.8 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.41 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.7 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.28 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.39 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.4 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.51 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.23 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>