265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2094 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  706    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.3 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.07 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  37.38 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  37.42 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  39.73 
 
 		 331 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  37.2 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  40.54 
 
 		 329 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  40.54 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  38.75 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  40.54 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.86 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.2 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  40.2 
 
 		 329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  40.2 
 
 		 329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  40.2 
 
 		 329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  39.26 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.91 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2081  hypothetical protein  38.38 
 
 		 313 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.15 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  35.47 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1802  hypothetical protein  35.6 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1627  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.77 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.92 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  33.75 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  33.12 
 
 		 324 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.52 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2785  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.45 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0917922  hitchhiker  0.00370167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.37 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.72 
 
 		 336 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  26.9 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.41 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.85 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0163  hypothetical protein  26.85 
 
 		 456 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.09 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3037  hypothetical protein  28 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.16 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.75 
 
 		 353 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1667 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.02 
 
 		 689 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  23.96 
 
 		 580 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  23.64 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.94 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.28 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.5 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  21.6 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.93 
 
 		 347 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.45 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.78 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  22.22 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  21.9 
 
 		 810 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.04 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  29.38 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.21 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  23.34 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.03 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  25.51 
 
 		 819 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  27.46 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.98 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.98 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.98 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.98 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.53 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  21.71 
 
 		 1094 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.1 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.29 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.48 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  23.43 
 
 		 1189 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1613  hypothetical protein  25.93 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144608  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.32 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.89 
 
 		 556 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.77 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3795  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.91 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3065  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.08 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.22 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.24 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.24 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.56 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.74 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.64 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.26 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.91 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  23.08 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.92 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.15 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.83 
 
 		 752 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.3 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.73 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>