More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0972 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
481 aa  986    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  56.72 
 
 
479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  52.1 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  35.94 
 
 
577 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  31.66 
 
 
552 aa  249  8e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.76 
 
 
564 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  33.18 
 
 
587 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  37.36 
 
 
563 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  34.31 
 
 
579 aa  228  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  33.33 
 
 
565 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  35.15 
 
 
568 aa  226  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  34.43 
 
 
580 aa  223  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  33.89 
 
 
564 aa  223  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  33.49 
 
 
553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  33.96 
 
 
572 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  33.81 
 
 
578 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.49 
 
 
592 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  32.86 
 
 
565 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  30.46 
 
 
595 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  31.2 
 
 
583 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.49 
 
 
578 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  33.1 
 
 
559 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  33.8 
 
 
572 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  32.39 
 
 
570 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  31.48 
 
 
574 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  32.21 
 
 
573 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  32.63 
 
 
571 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  32.38 
 
 
565 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  32.16 
 
 
571 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  31.72 
 
 
573 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  32.45 
 
 
573 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.41 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.65 
 
 
581 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  31.23 
 
 
574 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  30.82 
 
 
586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  29.59 
 
 
573 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  30.64 
 
 
577 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  30.86 
 
 
575 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 
585 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  29.36 
 
 
577 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.94 
 
 
576 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.23 
 
 
580 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  29.6 
 
 
610 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  27.34 
 
 
600 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  28.7 
 
 
576 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  28.87 
 
 
713 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  28.67 
 
 
603 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.16 
 
 
504 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  29.14 
 
 
505 aa  171  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  26.48 
 
 
636 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  26.54 
 
 
596 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.15 
 
 
508 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  27.97 
 
 
594 aa  158  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  27.66 
 
 
489 aa  156  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  28.95 
 
 
523 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.24 
 
 
517 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  28.03 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  27.82 
 
 
518 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.63 
 
 
539 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.81 
 
 
503 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  27.62 
 
 
518 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.82 
 
 
518 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.04 
 
 
516 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.12 
 
 
530 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.62 
 
 
518 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  25.54 
 
 
515 aa  140  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  27.02 
 
 
532 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.2 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.4 
 
 
558 aa  134  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.88 
 
 
515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  26.62 
 
 
529 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.22 
 
 
530 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.64 
 
 
508 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.64 
 
 
508 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3060  metallophosphoesterase  26.62 
 
 
460 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  25.86 
 
 
529 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  25.86 
 
 
529 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.4 
 
 
1215 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  25.66 
 
 
529 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  25.66 
 
 
529 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  25.66 
 
 
529 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.52 
 
 
627 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  25.71 
 
 
529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1952  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.53 
 
 
569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643025  normal  0.0714944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  25.93 
 
 
529 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.87 
 
 
555 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.45 
 
 
549 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.21 
 
 
1202 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25.05 
 
 
526 aa  120  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.93 
 
 
529 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.87 
 
 
520 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.63 
 
 
1284 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2669  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.92 
 
 
569 aa  119  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000803412  normal  0.0151204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  23.92 
 
 
657 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.32 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.07 
 
 
772 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.07 
 
 
772 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.91 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  25.49 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.65 
 
 
523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>