More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4154 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  64.54 
 
 		 559 aa  754    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  59.82 
 
 		 563 aa  693    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  60.35 
 
 		 565 aa  711    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  79.22 
 
 		 563 aa  955    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  58.94 
 
 		 578 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  59.82 
 
 		 565 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  63.36 
 
 		 553 aa  741    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 		 564 aa  1156    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  71.23 
 
 		 564 aa  858    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  50.8 
 
 		 565 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.18 
 
 		 576 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.53 
 
 		 580 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  50.36 
 
 		 576 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  49.73 
 
 		 610 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  50.27 
 
 		 574 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  50.71 
 
 		 575 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  52.21 
 
 		 570 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  52.59 
 
 		 571 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  48.12 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  49.48 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  52.36 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  49.3 
 
 		 574 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  51.44 
 
 		 571 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  51.21 
 
 		 572 aa  548  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  51.8 
 
 		 573 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  50 
 
 		 592 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  46.61 
 
 		 577 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  48.81 
 
 		 596 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  48.37 
 
 		 580 aa  521  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  48.16 
 
 		 583 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  44.5 
 
 		 600 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  46.59 
 
 		 603 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  46.33 
 
 		 586 aa  504  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  45.35 
 
 		 577 aa  501  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.79 
 
 		 578 aa  500  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.93 
 
 		 581 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  43.84 
 
 		 585 aa  481  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  40.55 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  39.9 
 
 		 636 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  41.61 
 
 		 568 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  38.88 
 
 		 572 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  38.61 
 
 		 579 aa  382  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  36.52 
 
 		 482 aa  260  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  37.76 
 
 		 481 aa  248  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.07 
 
 		 479 aa  220  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  28.73 
 
 		 505 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  28.38 
 
 		 595 aa  170  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.33 
 
 		 504 aa  166  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  27.52 
 
 		 594 aa  158  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  27.43 
 
 		 552 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  27.83 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  27.83 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  27.83 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.96 
 
 		 577 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.47 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  27.45 
 
 		 523 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  27.69 
 
 		 518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  27.69 
 
 		 518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  27.69 
 
 		 518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.69 
 
 		 518 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.69 
 
 		 518 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  26.55 
 
 		 546 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.02 
 
 		 516 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.69 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.37 
 
 		 508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.83 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  26.12 
 
 		 546 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  26.43 
 
 		 546 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  26.71 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  26.8 
 
 		 713 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.24 
 
 		 539 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  26.34 
 
 		 550 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  29.18 
 
 		 515 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.03 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.25 
 
 		 523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  27.97 
 
 		 547 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.46 
 
 		 517 aa  120  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  27.46 
 
 		 517 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.4 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1286  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  23.18 
 
 		 687 aa  112  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.82 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  24.55 
 
 		 633 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  27.47 
 
 		 505 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  25.68 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.59 
 
 		 515 aa  107  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  26.81 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  27.94 
 
 		 590 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.63 
 
 		 1284 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  24.82 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  26.31 
 
 		 581 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  28.01 
 
 		 556 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2272  5'-Nucleotidase domain protein  26.55 
 
 		 698 aa  102  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.28 
 
 		 508 aa  100  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.28 
 
 		 508 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  23.22 
 
 		 529 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  23.22 
 
 		 529 aa  100  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  28.02 
 
 		 512 aa  100  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.27 
 
 		 596 aa  99.8  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.46 
 
 		 509 aa  99.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  23.22 
 
 		 529 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>