More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4253 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  59.47 
 
 		 563 aa  720    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  62.48 
 
 		 559 aa  735    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  69.56 
 
 		 563 aa  834    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  91.5 
 
 		 578 aa  1090    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  64.49 
 
 		 553 aa  760    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 565 aa  1158    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  88.67 
 
 		 565 aa  1049    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  59.82 
 
 		 564 aa  715    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  60.95 
 
 		 564 aa  736    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  53.3 
 
 		 565 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  51.13 
 
 		 574 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  49.74 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  51.62 
 
 		 571 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  51.8 
 
 		 570 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  50.17 
 
 		 573 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  51.62 
 
 		 571 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.73 
 
 		 576 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  49.47 
 
 		 576 aa  538  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  50.09 
 
 		 572 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  47.3 
 
 		 577 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  49.73 
 
 		 574 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  50 
 
 		 573 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  48.04 
 
 		 573 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  48.28 
 
 		 610 aa  524  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.84 
 
 		 580 aa  524  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  47.4 
 
 		 575 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  46.19 
 
 		 596 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  44.39 
 
 		 586 aa  496  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  47.07 
 
 		 580 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  46.52 
 
 		 603 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.88 
 
 		 592 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  43.98 
 
 		 600 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  45.52 
 
 		 583 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  44.31 
 
 		 585 aa  488  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  46.58 
 
 		 577 aa  485  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.04 
 
 		 581 aa  488  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.74 
 
 		 578 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  39.02 
 
 		 587 aa  434  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  36.65 
 
 		 636 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  37.54 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  35.43 
 
 		 579 aa  383  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  34.85 
 
 		 572 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  34.87 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  32.86 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.87 
 
 		 479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  27.17 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.06 
 
 		 504 aa  153  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  28.26 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.38 
 
 		 508 aa  143  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.17 
 
 		 595 aa  136  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.48 
 
 		 516 aa  136  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  27.62 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  28.05 
 
 		 518 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  27.83 
 
 		 518 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.83 
 
 		 518 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  27.83 
 
 		 518 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  25.09 
 
 		 532 aa  124  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.6 
 
 		 518 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  27.79 
 
 		 577 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.12 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  26.52 
 
 		 594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.89 
 
 		 523 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  27.09 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  27.09 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  27.09 
 
 		 523 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.09 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.87 
 
 		 517 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.08 
 
 		 517 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.09 
 
 		 530 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25.64 
 
 		 526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.35 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  25.65 
 
 		 638 aa  110  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  26.6 
 
 		 713 aa  110  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  25.45 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.97 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.82 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  25.97 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  24.85 
 
 		 659 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  27.74 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.43 
 
 		 627 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  27.48 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.79 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.87 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.6 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.88 
 
 		 515 aa  102  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.58 
 
 		 657 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.75 
 
 		 607 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  24.22 
 
 		 546 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  24.66 
 
 		 546 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  26.58 
 
 		 520 aa  94.7  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 605 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  29.57 
 
 		 633 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 		 515 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  26.7 
 
 		 506 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  26.96 
 
 		 590 aa  92  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.33 
 
 		 535 aa  91.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  25.32 
 
 		 546 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  23.85 
 
 		 529 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  23.85 
 
 		 529 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  23.85 
 
 		 529 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>