197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2012 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  100 
 
 
713 aa  1464    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  38.38 
 
 
577 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  35.86 
 
 
595 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  28.87 
 
 
481 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  24.41 
 
 
552 aa  156  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  27.43 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.21 
 
 
479 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  29.38 
 
 
583 aa  147  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 
585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.61 
 
 
578 aa  140  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  27.04 
 
 
573 aa  140  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  26.54 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  28.93 
 
 
580 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  27.17 
 
 
573 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1286  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.88 
 
 
687 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.16 
 
 
564 aa  125  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  25.14 
 
 
587 aa  124  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  26.52 
 
 
574 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  24.47 
 
 
577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  27.66 
 
 
575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  26.82 
 
 
572 aa  120  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  24.64 
 
 
610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  26.82 
 
 
573 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  24.72 
 
 
574 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  24.83 
 
 
577 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  27.6 
 
 
571 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  25.73 
 
 
571 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  25.92 
 
 
570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  26.8 
 
 
553 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  24.56 
 
 
565 aa  114  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  26.14 
 
 
576 aa  114  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.89 
 
 
592 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  26.83 
 
 
559 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  26.14 
 
 
573 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.77 
 
 
580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 
578 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.94 
 
 
581 aa  111  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.91 
 
 
576 aa  111  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  28.06 
 
 
565 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  26.6 
 
 
565 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  25.53 
 
 
603 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.2 
 
 
568 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  25.34 
 
 
600 aa  108  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  26.36 
 
 
563 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  28.42 
 
 
594 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.44 
 
 
563 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  24.78 
 
 
636 aa  105  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  24.71 
 
 
564 aa  101  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  29.41 
 
 
619 aa  99  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  24.31 
 
 
579 aa  95.9  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  23.37 
 
 
596 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  24.15 
 
 
505 aa  92.4  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  21.92 
 
 
572 aa  88.6  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.62 
 
 
523 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  24.22 
 
 
504 aa  86.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.7 
 
 
508 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  24.59 
 
 
504 aa  79  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  24.26 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2414  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.17 
 
 
648 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2550  hypothetical protein  27.78 
 
 
697 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017247  hitchhiker  0.000000000139716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  25.94 
 
 
313 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.08 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  23.01 
 
 
515 aa  72.4  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2536  hypothetical protein  24.05 
 
 
650 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.19344e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2342  5'-nucleotidase  27.8 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.395983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2304  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.77 
 
 
650 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.199314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2261  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.35 
 
 
671 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0897144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1992  putative 2`,3`-cyclic-nucleotide 2`-phosphodiesterase  23.49 
 
 
634 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2743  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  23.75 
 
 
652 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0931599  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.79 
 
 
555 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  25.79 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  24.81 
 
 
558 aa  67.4  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.19 
 
 
517 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0600  5'-nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 
630 aa  65.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0113875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  29.18 
 
 
547 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7607  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  25.7 
 
 
585 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  21.37 
 
 
733 aa  64.3  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  28.25 
 
 
581 aa  63.9  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10661  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14310)  22.7 
 
 
666 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.88 
 
 
1175 aa  63.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.09 
 
 
503 aa  63.9  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  24.48 
 
 
638 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  24.08 
 
 
532 aa  62.4  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  25.75 
 
 
512 aa  62  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.68 
 
 
1181 aa  61.6  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.14 
 
 
523 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.58 
 
 
560 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  24.69 
 
 
560 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22.94 
 
 
523 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1174  metallophosphoesterase  25.07 
 
 
645 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00165263  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  22.94 
 
 
520 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  22.94 
 
 
520 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
315 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1760  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.89 
 
 
572 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0372367  hitchhiker  0.00627881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4198  5'-Nucleotidase domain protein  27.07 
 
 
631 aa  60.1  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.2 
 
 
596 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1299  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.74 
 
 
615 aa  58.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.35 
 
 
530 aa  57.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.43 
 
 
539 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2311  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.91 
 
 
572 aa  57.4  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>