More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0692 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  100 
 
 
583 aa  1190    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  54.89 
 
 
586 aa  663    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  53.42 
 
 
585 aa  655    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  71.38 
 
 
580 aa  857    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  57.74 
 
 
578 aa  655    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  66.01 
 
 
592 aa  775    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  51.1 
 
 
573 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  55.04 
 
 
572 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  52.72 
 
 
574 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.68 
 
 
576 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.26 
 
 
580 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  52.81 
 
 
573 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  53.07 
 
 
571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  53.41 
 
 
570 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  50.93 
 
 
610 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  53.15 
 
 
571 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  51.61 
 
 
573 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  52.22 
 
 
574 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  49.32 
 
 
576 aa  571  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  52.81 
 
 
573 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  48.95 
 
 
565 aa  568  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  51.1 
 
 
575 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  45.7 
 
 
636 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  46.02 
 
 
600 aa  555  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  46.88 
 
 
577 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  49.39 
 
 
559 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.59 
 
 
564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  46.03 
 
 
563 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.11 
 
 
563 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  48.18 
 
 
553 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  46.91 
 
 
603 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  45.34 
 
 
565 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  44.68 
 
 
596 aa  495  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  45.34 
 
 
565 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  44.5 
 
 
578 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  45.8 
 
 
564 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  40.46 
 
 
577 aa  462  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.5 
 
 
581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  38.03 
 
 
587 aa  436  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  39.4 
 
 
568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  36.08 
 
 
579 aa  393  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  38.39 
 
 
572 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  33.41 
 
 
482 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  31.2 
 
 
481 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.07 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  28.96 
 
 
552 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.52 
 
 
595 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  29.38 
 
 
713 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  28.48 
 
 
577 aa  136  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.32 
 
 
508 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  28.9 
 
 
504 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  27.12 
 
 
546 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  27.5 
 
 
546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  26.73 
 
 
546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  26.42 
 
 
550 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  27.93 
 
 
505 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.99 
 
 
657 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  25.81 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.92 
 
 
659 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  27.84 
 
 
638 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.35 
 
 
520 aa  108  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  29.45 
 
 
512 aa  107  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27 
 
 
503 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.11 
 
 
530 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  24.58 
 
 
520 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.58 
 
 
520 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.72 
 
 
627 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.58 
 
 
523 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.71 
 
 
515 aa  101  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.52 
 
 
523 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  30.17 
 
 
638 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  25.39 
 
 
518 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  27.65 
 
 
504 aa  95.9  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  25.17 
 
 
518 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  25.17 
 
 
518 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.6 
 
 
535 aa  94.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.16 
 
 
1215 aa  94  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.25 
 
 
523 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.94 
 
 
518 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.17 
 
 
518 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  27.14 
 
 
520 aa  93.2  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  27.43 
 
 
547 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.18 
 
 
533 aa  92.8  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.88 
 
 
517 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7607  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  26.21 
 
 
585 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.95 
 
 
1202 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1908  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.62 
 
 
572 aa  90.9  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00316066  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.25 
 
 
523 aa  90.9  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25.58 
 
 
526 aa  90.9  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3374  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.73 
 
 
527 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  31.8 
 
 
581 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  32.23 
 
 
619 aa  87.8  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3393  5'-nucleotidase; 2',3'-cyclic phosphodiesterase  25.76 
 
 
527 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.803597  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  25.05 
 
 
527 aa  87.4  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.24 
 
 
508 aa  87.4  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  29.08 
 
 
302 aa  87.4  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.24 
 
 
508 aa  87.4  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  22.2 
 
 
594 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.26 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.59 
 
 
1284 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>